龙虎山自然保护区地处北回归线,属广西北热带石灰季节性雨林,植物区系属印度—马来西亚热带植物区的中越边境植物省。动植物资源十分丰富,目前发现植物种类157科583属1200多种,其中药物占713种;属国家重点一、二级保护植物的有石山苏铁、金毛狗、樟树、任豆、蚬木、蒜头果等共6种;属广西特有植物的有石山楠、黑楠、米念芭、蝴蝶藤、肥牛树、广西九里香、龙州细子龙等7种;属龙虎山特有植物的有毛瓣金花茶、石山蜘蛛抱蛋、棒蕊蜘蛛抱蛋、伞柱蜘蛛抱蛋、隆安蜘蛛抱蛋、广西球子草、长穗开口箭等7种。
保护区内现有野生脊椎动物215种,其中哺乳动物50种,鸟类132种。属国家重点保护动物的有黑叶猴、熊猴、蟒蛇、猕猴、鸳鸯、冠斑犀鸟、白鹇、大灵猫、小灵猫等共26种。属广西地方重点保护动物达89种。
动物资源中,最为引人注目的是龙虎山的猕猴,自1983年开始人工定点投喂以来,已由原来的100多只发展至现在的8大群共3000多只。